Nhà máy xử lý chất thải tại Phù Lãng có diện tích hơn 99.531 m², được xếp vào nhóm I theo tiêu chí môi trường, với nhiều hạng mục xử lý và tái chế chất thải nguy hại, chất thải công nghiệp. Công suất thiết kế của cơ sở bao gồm lò đốt chất thải 72 tấn/ngày; hệ thống súc rửa bao bì, thùng phuy; xử lý ắc quy và pin thải; tái chế dầu nhớt, dung môi, nhựa; xử lý chất thải điện tử; tái chế kim loại, bụi lò thép, than hoạt tính. Ngoài ra, nhà máy còn vận hành hai hệ thống xử lý nước thải với công suất 200 m³/ngày và 500 m³/ngày.
Theo quy định trong giấy phép, tổng lưu lượng nước thải tối đa được xả ra môi trường là 700 m³/ngày. Trong số này, khoảng 200 m³/ngày có thể được tuần hoàn tái sử dụng khi có nhu cầu. Nguồn tiếp nhận nước thải là kênh tiêu trạm bơm An Trạch tại xã Phù Lãng. Nước thải sau xử lý phải bảo đảm đáp ứng các quy chuẩn kỹ thuật quốc gia về nước thải công nghiệp theo lộ trình áp dụng đến và sau năm 2032. Nhà máy đã lắp đặt hệ thống quan trắc nước thải tự động, vận hành liên tục và truyền dữ liệu về cơ quan quản lý để theo dõi, giám sát.
Đối với khí thải, giấy phép xác định 10 dòng khí phát sinh từ các khu vực như lò đốt chất thải, khu tái chế dầu nhớt, dung môi, nhựa, khu xử lý ắc quy và kim loại. Các dòng khí này phải được thu gom, xử lý đạt quy chuẩn kỹ thuật trước khi thải ra môi trường. Riêng hệ thống lò đốt chất thải phải tuân thủ các quy chuẩn hiện hành và các quy chuẩn mới dự kiến áp dụng từ ngày 1/1/2032. Hệ thống quan trắc khí thải tự động, liên tục đã được lắp đặt tại ống khói lò đốt và kết nối truyền dữ liệu về cơ quan quản lý môi trường của tỉnh Bắc Ninh.
Giấy phép môi trường cũng quy định cụ thể các yêu cầu về kiểm soát tiếng ồn, độ rung; quản lý chất thải nguy hại; cũng như phương án phòng ngừa và ứng phó sự cố môi trường trong quá trình vận hành. Doanh nghiệp có trách nhiệm thực hiện vận hành thử nghiệm một số hệ thống xử lý khí thải trong thời gian 6 tháng kể từ khi giấy phép có hiệu lực.
Bộ Nông nghiệp và Môi trường giao các đơn vị chuyên môn chủ trì, phối hợp với cơ quan quản lý môi trường địa phương tổ chức kiểm tra, giám sát việc thực hiện các nội dung cấp phép, bảo đảm cơ sở vận hành đúng quy định và đáp ứng yêu cầu bảo vệ môi trường.
