Trước khi tham dự vòng chung kết, đã có 23 đội tham gia vòng loại ở 4 bảng đấu. Kết thúc vòng loại chọn ra 10 đội gồm: U21 Hà Nội, U21 Viettel, U21 Đông Á Thanh Hoá, HAGL, Khánh Hòa và Đà Nẵng, Bình Dương và Gia Định, Học viện bóng đá Nutifood và Đồng Tháp. 10 đội bóng này cùng với 2 đội chủ nhà U21 Sông Lam Nghệ An và U21 Hồng Lĩnh Hà Tĩnh sẽ vào thi đấu vòng chung kết.
Tại buổi bốc thăm chia bảng, Ban Tổ chức đã thống nhất nguyên tắc bốc thăm cho 12 đội tham dự chung kết giải được phân chia như sau: Có 3 bảng thi đấu chung kết giải, mỗi bảng 4 đội. Bảng A và B thi đấu tại sân Vinh và sân phụ (sân tập CLB Sông Lam Nghệ An), bảng C thi đấu tại sân Hà Tĩnh. Chủ nhà Sông Lam Nghệ An nằm ở bảng A ký hiệu A1, đồng chủ nhà Hà Tĩnh nằm ở bảng C ký hiệu C1.
Kết quả bốc thăm tại buổi lễ, U21 Sông Lam Nghệ An nằm ở bảng A cùng với các đội U21 Hoàng Anh Gia Lai, U21 Đông Á Thanh Hoá, U21 Đà Nẵng; Bảng B gồm các đội, U21 B.Bình Dương, U21 Nutifood, U21 Hà Nội, U21 Khánh Hoà; Bảng C gồm, U21 Hồng Lĩnh Hà Tĩnh, U21 Viettel, U21 Gia Định, U21 Đồng Tháp.
Trận đấu khai mạc Giải Bóng đá U21 Quốc gia 2022, sẽ diễn ra trên sân Vinh vào ngày 17/12 giữa hai đội U21 Sông Lam Nghệ An và U21 Đà Nẵng.
